LNA oligo e probe
New LNA oligo e probe
Gli oligo LNA (Locke Nucleic Acid) sono degli oligo che contengono una modifica all'acido nucleico: in pratica viene aggiunto un ponte di metilene che collega l'ossigeno al 2' al carbonio 4' dell'anello pentoso.
Questo ponte, "blocca" il carbonio che non richiede protezione come per gli altri nucleotidi; gli oligo ad LNA sono solubili in acqua o in buffer, poiché la modifica coinvolge solo lo scheletro dell'acido nucleico e non interferisce con i nucleosidi, quindi la solubilità resta invariata.
I vantaggi degli oligo ad LNA:
- maggiore stabilità termica
- aumentata specificità di ibridazione
- aumento della Tm per primer e sonde brevi e ricche di AT AT (ΔTm / base bloccata circa 2-6 ° C a seconda della composizione della sequenza e degli effetti di "vicinato")
- stabilità migliorata sia in vitro che in vivo grazie all'aumentata resistenza all'endo e all'esonucleasi
- Elementi costitutivi non tossici, efficienti ed efficaci per l'incorporazione in antisenso, m-RNA o altri candidati allo sviluppo di farmaci a base di acido nucleico
Gli LNA sono utili quando:
- si devono discriminare mismatch/SNP/allelic
- valori di cT molto precoci
- quando il rapporto tra segnale di fondo e segnale è molto alto
- facilitano il disegno di sonde per target molto specifici o in cui la sequenza è molto discriminante
